Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms