Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a5Q3TYU2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp13a5Q3TYU2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms