Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms