Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38aQ3TMP8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms