Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrc2cQ3TLH4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrc2cQ3TLH4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrc2cQ3TLH4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrc2cQ3TLH4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prrc2cQ3TLH4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrc2cQ3TLH4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms