Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fubp3Q3TIX6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fubp3Q3TIX6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms