Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc13Q3TIR1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms