Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afvQ3THW5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2afvQ3THW5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms