Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat1Q3TFD2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms