Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms