Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riiad1Q3KNY5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms