Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KncnQ307W7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KncnQ307W7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KncnQ307W7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KncnQ307W7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KncnQ307W7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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KncnQ307W7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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KncnQ307W7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KncnQ307W7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms