Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm1Q2TV84 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms