Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms