Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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