Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Myo3bQ1EG27 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms