Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cers3Q1A3B0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cers3Q1A3B0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms