Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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GEN1Q17RS7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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GEN1Q17RS7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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GEN1Q17RS7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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GEN1Q17RS7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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GEN1Q17RS7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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