Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms