Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5cQ0V8T7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Cntnap5cQ0V8T7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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