Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms