Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms