Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms