Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms