Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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