Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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