Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ebf1Q07802 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms