Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms