Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cntn3Q07409 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms