Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms