Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Caprin2Q05A80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms