Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms