Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk18Q04899 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms