Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms