Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms