Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms