Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms