Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms