Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GscQ02591 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GscQ02591 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms