Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh1Q02576 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms