Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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