Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms