Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja5Q01231 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms