Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms