Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms