Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms