Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms