Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms