Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp9bP98195 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp9bP98195 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms