Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms